Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIN1Q05586 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms