Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms