Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME1P48163 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ME1P48163 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ME1P48163 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ME1P48163 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME1P48163 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME1P48163 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME1P48163 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms