Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ECI1P42126 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ECI1P42126 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ECI1P42126 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ECI1P42126 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECI1P42126 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECI1P42126 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECI1P42126 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECI1P42126 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECI1P42126 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECI1P42126 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECI1P42126 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECI1P42126 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ECI1P42126 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms