Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA3P25788 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms