Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPREP23469 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms