Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHCEP18577 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHCEP18577 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHCEP18577 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHCEP18577 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHCEP18577 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHCEP18577 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms