Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2F6O75461 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F6O75461 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F6O75461 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms