Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R2Q9NY27 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP4R2Q9NY27 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms