Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMSN1Q9NSI8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms