Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms