Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALS2CR12Q96Q35 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms