Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSIP1Q8NA03 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms