Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms