Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF19Q5T6S3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms