Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL22Q53GT1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms