Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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