Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SKP2Q13309 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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