Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC16Q13042 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC16Q13042 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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