Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 FAM157C-203ENST00000568070 480 ntTSL 310.48□□□□□ -0.731e-14■■■□□ 15
ILF3Q12906 FAM157C-204ENST00000570230 2184 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.81e-14■■■□□ 15
ILF3Q12906 FNDC3B-208ENST00000476794 682 ntTSL 35.36□□□□□ -1.557e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 LPP-204ENST00000420410 535 ntTSL 318.98■□□□□ 0.631e-6■■■□□ 15
ILF3Q12906 LPP-207ENST00000443217 400 ntTSL 314.1□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 15
ILF3Q12906 LPP-206ENST00000430340 521 ntTSL 310.64□□□□□ -0.711e-6■■■□□ 15
ILF3Q12906 LPP-209ENST00000454789 343 ntTSL 58.81□□□□□ -11e-6■■■□□ 15
ILF3Q12906 LPP-203ENST00000416784 612 ntTSL 38.61□□□□□ -1.031e-6■■■□□ 15
ILF3Q12906 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.081e-6■■■□□ 15
ILF3Q12906 LPP-205ENST00000426274 386 ntTSL 57.05□□□□□ -1.281e-6■■■□□ 15
ILF3Q12906 LPP-201ENST00000414139 502 ntTSL 46.9□□□□□ -1.31e-6■■■□□ 15
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ILF3Q12906 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.941e-6■■■□□ 15
ILF3Q12906 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.752e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.812e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SLC7A8-203ENST00000397310 2719 ntTSL 29.29□□□□□ -0.922e-7■■■□□ 15
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ILF3Q12906 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.142e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.233e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.433e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.33e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.33e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 SDC2-205ENST00000520233 563 ntTSL 417.48■□□□□ 0.398e-7■■■□□ 15
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ILF3Q12906 SDC2-203ENST00000519587 557 ntTSL 413.92□□□□□ -0.188e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.38e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SDC2-207ENST00000522911 677 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.98e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■□□ 15
ILF3Q12906 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.383e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 WDR59-214ENST00000568323 558 ntTSL 517.24■□□□□ 0.353e-7■■■□□ 15
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ILF3Q12906 WDR59-223ENST00000616369 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.683e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 WDR59-204ENST00000562331 570 ntTSL 410.35□□□□□ -0.753e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.113e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SERPINF1-204ENST00000571149 431 ntTSL 316.78■□□□□ 0.284e-13■■■□□ 15
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ILF3Q12906 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.218e-7■■■□□ 15
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ILF3Q12906 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.558e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SERPINF1-202ENST00000570731 459 ntTSL 511.56□□□□□ -0.564e-13■■■□□ 15
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ILF3Q12906 HECTD1-210ENST00000555843 4281 ntTSL 24.66□□□□□ -1.665e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 HECTD1-205ENST00000554027 556 ntTSL 23.24□□□□□ -1.895e-9■■■□□ 15
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ILF3Q12906 INTS11-235ENST00000527719 750 ntTSL 518.88■□□□□ 0.614e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.594e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 418.7■□□□□ 0.584e-9■■■□□ 15
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ILF3Q12906 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.54e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 217.58■□□□□ 0.44e-9■■■□□ 15
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ILF3Q12906 INTS11-233ENST00000527098 2004 ntTSL 214.38□□□□□ -0.114e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.114e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.164e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 INTS11-229ENST00000526113 591 ntTSL 513.7□□□□□ -0.224e-9■■■□□ 15
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ILF3Q12906 INTS11-245ENST00000533916 405 ntTSL 211.3□□□□□ -0.64e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 INTS11-212ENST00000462432 2863 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.624e-9■■■□□ 15
ILF3Q12906 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 517.93■□□□□ 0.468e-12■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 CTTN-212ENST00000527962 587 ntTSL 215.81■□□□□ 0.128e-12■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 PI4KA-207ENST00000466772 3109 ntTSL 212.96□□□□□ -0.338e-12■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 PI4KA-209ENST00000477245 3026 ntTSL 1 (best)12.15□□□□□ -0.468e-12■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 CTTN-208ENST00000498223 523 ntTSL 311.28□□□□□ -0.68e-12■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.177e-7■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 AC140504.1-201ENST00000568766 498 ntAPPRIS P1 TSL 223.39■■□□□ 1.338e-7■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.538e-7■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.38e-7■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 AC140504.1-203ENST00000567442 476 ntTSL 216.88■□□□□ 0.298e-7■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.575e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 PPP2R2A-218ENST00000522535 653 ntTSL 422.56■■□□□ 1.27e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.17e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.977e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.887e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.167e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 KDM3A-206ENST00000452034 709 ntTSL 515.17■□□□□ 0.027e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.027e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 KDM3A-204ENST00000427678 565 ntTSL 214.78□□□□□ -0.047e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 PPP2R2A-206ENST00000518254 755 ntTSL 513.96□□□□□ -0.177e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 PPP2R2A-211ENST00000520329 836 ntTSL 513.96□□□□□ -0.177e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 PPP2R2A-223ENST00000524169 784 ntTSL 313.3□□□□□ -0.287e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.357e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 MOV10-205ENST00000465579 610 ntTSL 210.24□□□□□ -0.777e-8■■■□□ 14.9
ILF3Q12906 MOV10-208ENST00000475429 582 ntTSL 39.77□□□□□ -0.857e-8■■■□□ 14.9
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