Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2P24941 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2P24941 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDK2P24941 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDK2P24941 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2P24941 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2P24941 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2P24941 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2P24941 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2P24941 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2P24941 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2P24941 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2P24941 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2P24941 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms