Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCMT1P22061 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms