Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APAF1O14727 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APAF1O14727 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APAF1O14727 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APAF1O14727 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms