Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCER2I3L3R5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms