Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXTL2Q9UBQ6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms