Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NLKQ9UBE8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NLKQ9UBE8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms