Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VNN3Q9NY84 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms