Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms