Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCMBPQ9BTE3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms