Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms