Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EME1Q96AY2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EME1Q96AY2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EME1Q96AY2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EME1Q96AY2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EME1Q96AY2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EME1Q96AY2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EME1Q96AY2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EME1Q96AY2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
EME1Q96AY2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms