Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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