Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms