Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLX4IPQ5VYV7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLX4IPQ5VYV7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms