Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD51Q06609 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD51Q06609 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms