Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6Q03468 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms