Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms