Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRISP1P54107 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRISP1P54107 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms