Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1P21675 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1P21675 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1P21675 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1P21675 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1P21675 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1P21675 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1P21675 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms