Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOC3P02656 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOC3P02656 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOC3P02656 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOC3P02656 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOC3P02656 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOC3P02656 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms