Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3O95983 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3O95983 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3O95983 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3O95983 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3O95983 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3O95983 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3O95983 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3O95983 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3O95983 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3O95983 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms