Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms