Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAPRE3Q9UPY8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms