Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NINJ2Q9NZG7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms