Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXT2Q93063 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms