Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms