Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms