Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms