Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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