Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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